奈克松油田開采深海油田遭到環(huán)保界的一致否定，于是克莉絲汀 吉婷斯和他助手?jǐn)z影師杰克一起去采訪該油田負(fù)責(zé)人彼得 貝瑞雪。期間他們在檢查海底吸管的時候意外的發(fā)現(xiàn)了史前才有的生物。一日，他們乘坐升降器在海底觀測，而潛艇駕駛員麥姿則駕駛潛艇鉆孔探油卻掉入了一個奇妙的洞穴之中，里面景色光怪陸離，絢麗異常。然而噩夢卻開始了，某夜記者克莉絲汀為一陣震動吵醒，于是和杰克及醫(yī)師兼安全主任帕克斯、工程師麥金尼、潛水員艾略特共同乘坐升降器到海底觀察，而麥姿和葛瑞迪則駕駛潛艇，就在這時一個龐然大物出現(xiàn)了，卻是存在于六千五百萬年前的史前巨鯊巨齒鯊，在葛瑞迪葬身魚腹之后眾人紛紛逃命，卻不想巨齒鯊被震動所吸引，不停撞擊下，眾人不得不解開升降器鐵鎖，任其上升到海面，由直升機解救，這時麥姿用潛艇在將他們頂?shù)奖鶋K之上后遭到了鯊魚的攻擊終于還是被吞噬掉了，而麥金尼由于在上升過程中腳受了重傷，行動不便也遭到鯊魚毒手。艾略特悲痛欲絕，在心愛女友和同伴相繼遭鯊魚殘害之后，他決定用炸彈滅殺這條史前狂鯊，于是在帕克斯的幫助下，他駕駛潛艇下到海底與鯊魚一番大戰(zhàn)并同歸于盡。

家住密西西比河邊的14歲少年埃利斯（泰伊·謝里丹 Tye Sheridan 飾）和好友奈克在河中心小島上發(fā)現(xiàn)了一艘廢棄的船，同時還有暫住在船上的神秘流浪男子瑪?shù)拢R修·麥康納 Matthew McConaughey 飾）?，?shù)伦苑Q幼年時生活于此，因行動不便拜托埃斯利和奈克給予他幫助。家庭處于分崩離析邊緣的埃利斯近于本能的信任瑪?shù)拢蚝笳咛峁┦澄?，并了解到瑪?shù)屡c青梅竹馬戀人珍妮弗（瑞茜·威瑟斯彭 Reese Witherspoon 飾）癡纏多年并為之殺人的往事，原來瑪?shù)麓丝淘诠聧u上正是躲避賞金獵人追殺的同時欲帶走珍妮弗。埃利斯愿意相信瑪?shù)碌膼矍?，盡管生活充滿了令人失望的底色，他愿意助這位陌生的大朋友一臂之力……

故事發(fā)生在遙遠(yuǎn)的未來，肆虐的異生獸給人類的安全帶來了巨大的困擾，為了抵擋異獸的進(jìn)攻，日本政府成立了防衛(wèi)組織TLT，其中，夜襲隊擁有著最強大的實力和最強勁的武器，是整個組織內(nèi)部的中堅力量?！　∪欢鎸?jīng)過了進(jìn)化的新型異生獸，夜襲隊亦束手無策，在這個節(jié)骨眼上，光之巨人奈克瑟斯奧特曼和它的適能者姫矢準(zhǔn)（桐島優(yōu)介 飾）出現(xiàn)了。在奈克瑟斯奧特曼創(chuàng)造出的美塔領(lǐng)域中，奧特曼和異獸之間展開了激烈的斗爭。孤門一輝（川久保拓司 飾）是TLT里的新進(jìn)成員，當(dāng)他目睹了奈克瑟斯奧特曼強大的力量后，開始對奧特曼的起源和姬矢準(zhǔn)的神秘過往產(chǎn)生了興趣。